Não há tratamento específico para a febre amarela. O paciente deve ficar isolado em hospital, de maneira que nenhum mosquito possa picá-lo e transmitir a doença a outras pessoas, recebendo cuidados de acordo com a gravidade do caso.
Os casos graves necessitam de terapia intensiva. Não há terapia antiviral disponível para tratamento. O paciente deve receber suporte de acordo com os sintomas, recebendo oxigênio, hidratação e tratamento dos sangramentos com plasma fresco congelado e vitamina K. Não se deve medicar esses pacientes com remédios que sejam metabolizados pelo fígado cuja função está muito alterada pela doença.