Ao longo dos anos, a soja ganhou bastante atenção por seu papel importante na redução do colesterol no sangue. Em 1995, uma avaliação de 38 ensaios clínicos descobriu que, em média, a proteína de soja diminuiu o colesterol total em mais de 9% e o colesterol LDL em aproximadamente 13%. Entretanto, a resposta à proteína de soja dependia do nível de colesterol no sangue antes do início do tratamento. As pessoas com níveis de colesterol total superiores a 335 mg/dia tiraram maior proveito, enquanto as com níveis de colesterol inferiores a 260 mg/dia apresentam apenas uma diminuição modesta dos níveis
Em 1999, com base nas pesquisas feitas, o Food and Drug Administration aprovou os produtos que continham no mínimo 6,25 g de proteína de soja por porção afirmando que as dietas pobres em gordura saturada e colesterol que incluem 25 g de proteína de soja por dia podem reduzir o risco de doença cardíaca.
Mas nem todas as pesquisas realizadas nos últimos dez anos concluíram que a proteína de soja diminui o colesterol. Em 2006, o Comitê de Nutrição da Associação Americana para o Coração analisou 22 estudos sobre a proteína de soja e descobriu que uma grande quantidade dela - na verdade, cerca de metade da proteína diária total consumida em um dia - diminuía o colesterol em apenas 3%, aproximadamente. Ao avaliar 19 estudos sobre as isoflavonas, um componente da soja, o Comitê não encontrou evidências de redução do colesterol LDL.
Os efeitos benéficos da soja podem estar na substituição dos produtos de origem animal, que são ricos em gordura saturada e colesterol, por produtos de soja, como tofu, nozes de soja e hambúrguer de soja, que são pobres em gordura saturada e ricos em gordura poliinsaturada, fibra e nutrientes.
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